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强直性脊柱炎的易感性遗传抗原大部分由HLA-B27决定。但也有一些其他基因,比如HLA-B家族中除HLA-B27以外的基因、HIA-DR基因、LMP和TAP基因、MICA基因,这些都与强直性脊柱炎的发病有关,只是携带者较少而未被过分关注。

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